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《重庆医科大学学报杂志社》是重庆医科大学主办的具有较高专业学术水平的综合性医学期刊，目前已被维普科技、万方数据、中国知网全文收录，被美国化学文摘(CA)、波兰《哥白尼索引》(IC)、美国《乌利希期刊指南》、世界卫生组织《西太平洋地区医学索引》和美国《剑桥科学文摘(自然科学)》收录，属于中国科技核心期刊、CSCD遴选期刊、中文核心期刊和中国高校优秀科技期刊。
《重庆医科大学学报杂志社》主要栏目：设有基础研究、技术与方法、临床研究、调查研究、经验交流、病例分析、短篇论著、个案与短篇等主要栏目，并不定期设立肿瘤分子学相关研究、临床病理分析、临床药理、科技成果转化快讯、学术争鸣、研究热点等栏目，同时为高水平医学学术会议开设相关领域会议论文专辑或论文专栏。
《重庆医科大学学报杂志社》为提高刊物学术质量，吸收高水平学术论文，《重庆医科大学学报杂志社》特设快速通道，对国家自然科学基金课题、省部级各种基金课题、重大研究成果论文给予优先刊用。
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